Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Eme2Q56A04 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eme2Q56A04 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms