Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog7Q3UM29 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms