Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U595 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U595 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U595 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U595 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U595 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U595 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U595 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U595 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U595 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U595 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U595 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U595 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U595 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U595 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U595 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U595 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U595 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U595 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U595 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U595 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U595 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U595 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U595 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U595 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U595 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U595 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U595 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U595 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U595 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U595 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U595 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U595 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U595 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U595 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U595 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U595 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U595 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U595 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U595 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U595 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U595 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U595 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U595 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U595 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U595 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U595 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U595 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U595 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U595 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U595 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U595 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U595 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U595 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U595 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U595 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U595 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U595 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U595 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U595 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U595 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U595 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U595 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U595 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U595 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms