Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Serac1Q3U213 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serac1Q3U213 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms