Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd2bQ3T9M1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd2bQ3T9M1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mfsd2bQ3T9M1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd2bQ3T9M1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd2bQ3T9M1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd2bQ3T9M1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd2bQ3T9M1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd2bQ3T9M1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms