Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam178bQ24JP3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam178bQ24JP3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam178bQ24JP3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms