Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thbs3Q05895 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thbs3Q05895 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms