Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx2Q04744 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Emx2Q04744 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Emx2Q04744 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms