Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly9Q01965 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly9Q01965 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms