Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbp1Q00915 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp1Q00915 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp1Q00915 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms