Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata5P97489 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata5P97489 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata5P97489 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata5P97489 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata5P97489 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms