Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx3P70354 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx3P70354 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msx3P70354 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msx3P70354 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx3P70354 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx3P70354 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx3P70354 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx3P70354 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx3P70354 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx3P70354 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx3P70354 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx3P70354 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx3P70354 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms