Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb13P70321 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb13P70321 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms