Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig1P70193 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms