Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabra1P62812 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabra1P62812 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms