Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtdsplP58465 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtdsplP58465 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtdsplP58465 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms