Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd38P56528 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd38P56528 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd38P56528 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms