Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rad23aP54726 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad23aP54726 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms