Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CitP49025 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CitP49025 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CitP49025 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CitP49025 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CitP49025 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CitP49025 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CitP49025 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CitP49025 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CitP49025 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CitP49025 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CitP49025 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CitP49025 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CitP49025 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CitP49025 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CitP49025 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CitP49025 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CitP49025 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CitP49025 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CitP49025 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CitP49025 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CitP49025 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CitP49025 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CitP49025 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CitP49025 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CitP49025 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CitP49025 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CitP49025 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CitP49025 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CitP49025 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CitP49025 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CitP49025 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CitP49025 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CitP49025 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CitP49025 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CitP49025 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CitP49025 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CitP49025 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CitP49025 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CitP49025 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CitP49025 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CitP49025 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CitP49025 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CitP49025 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CitP49025 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CitP49025 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CitP49025 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CitP49025 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CitP49025 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CitP49025 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CitP49025 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CitP49025 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CitP49025 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CitP49025 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CitP49025 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CitP49025 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CitP49025 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CitP49025 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CitP49025 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CitP49025 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CitP49025 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CitP49025 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CitP49025 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CitP49025 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CitP49025 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CitP49025 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CitP49025 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CitP49025 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CitP49025 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CitP49025 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CitP49025 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CitP49025 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CitP49025 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CitP49025 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CitP49025 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CitP49025 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CitP49025 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CitP49025 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CitP49025 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CitP49025 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CitP49025 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CitP49025 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CitP49025 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CitP49025 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CitP49025 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CitP49025 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CitP49025 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CitP49025 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CitP49025 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CitP49025 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CitP49025 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms