Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brca1P48754 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brca1P48754 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brca1P48754 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca1P48754 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brca1P48754 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brca1P48754 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brca1P48754 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brca1P48754 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms