Protein–RNA interactions for Protein: P35831

Ptpn12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn12P35831 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn12P35831 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn12P35831 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn12P35831 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn12P35831 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn12P35831 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn12P35831 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn12P35831 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpn12P35831 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn12P35831 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms