Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola2P33611 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola2P33611 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola2P33611 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pola2P33611 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pola2P33611 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pola2P33611 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola2P33611 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola2P33611 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pola2P33611 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pola2P33611 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola2P33611 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pola2P33611 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms