Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gadd45bP22339 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gadd45bP22339 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms