Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PcnaP17918 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PcnaP17918 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PcnaP17918 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PcnaP17918 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcnaP17918 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PcnaP17918 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PcnaP17918 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PcnaP17918 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PcnaP17918 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PcnaP17918 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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