Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spi1P17433 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spi1P17433 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spi1P17433 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms