Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irf1P15314 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irf1P15314 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Irf1P15314 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irf1P15314 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irf1P15314 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irf1P15314 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf1P15314 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irf1P15314 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf1P15314 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irf1P15314 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf1P15314 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf1P15314 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf1P15314 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms