Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatspereP0DP43 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatspereP0DP43 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms