Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CaskO70589 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CaskO70589 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CaskO70589 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CaskO70589 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CaskO70589 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CaskO70589 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CaskO70589 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CaskO70589 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CaskO70589 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CaskO70589 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CaskO70589 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CaskO70589 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CaskO70589 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CaskO70589 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CaskO70589 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CaskO70589 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CaskO70589 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CaskO70589 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CaskO70589 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CaskO70589 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CaskO70589 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CaskO70589 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CaskO70589 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CaskO70589 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CaskO70589 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CaskO70589 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CaskO70589 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CaskO70589 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CaskO70589 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CaskO70589 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CaskO70589 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CaskO70589 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CaskO70589 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CaskO70589 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CaskO70589 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CaskO70589 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CaskO70589 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CaskO70589 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CaskO70589 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CaskO70589 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CaskO70589 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CaskO70589 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CaskO70589 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CaskO70589 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CaskO70589 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CaskO70589 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CaskO70589 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CaskO70589 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CaskO70589 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CaskO70589 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CaskO70589 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CaskO70589 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CaskO70589 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CaskO70589 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CaskO70589 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CaskO70589 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CaskO70589 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms