Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptlc1O35704 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptlc1O35704 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms