Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4dL7N216 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4dL7N216 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4dL7N216 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4dL7N216 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms