Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20830J3KML6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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