Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tubgcp6G5E8P0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tubgcp6G5E8P0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms