Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim55G3X8Y1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim55G3X8Y1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms