Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scaf11E9PZM7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Scaf11E9PZM7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Scaf11E9PZM7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms