Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
FgaE9PV24 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgaE9PV24 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms