Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc6D3YZP9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc6D3YZP9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc6D3YZP9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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