Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ldlrad1D3YYZ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ldlrad1D3YYZ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ldlrad1D3YYZ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ldlrad1D3YYZ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms