Protein–RNA interactions for Protein: B9EKX1

Ptchd4, Patched domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 904 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd4B9EKX1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptchd4B9EKX1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptchd4B9EKX1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptchd4B9EKX1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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