Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SktA2AQ25 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SktA2AQ25 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SktA2AQ25 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms