Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDK0

3110040M04Rik, Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110040M04RikA0A286YDK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
3110040M04RikA0A286YDK0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
3110040M04RikA0A286YDK0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
3110040M04RikA0A286YDK0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms