Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms