Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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