Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ubl3Q9Z2M6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ubl3Q9Z2M6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms