Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms