Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lgr5Q9Z1P4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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