Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms