Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vax2Q9WTP9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Vax2Q9WTP9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vax2Q9WTP9 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vax2Q9WTP9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vax2Q9WTP9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vax2Q9WTP9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vax2Q9WTP9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vax2Q9WTP9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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