Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms