Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms