Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms